Мечеть является образцом центрально-купольного здания.
Мечеть является образцом центрально-купольного здания. Над зданием мечети возвышается минарет, башня с балконом, с которой провозглашают призыв на молитву. К молитвенному залу примыкает крытое помещение, где перед молитвой совершают вуду (малое омовение).
В задней стене молитвенного зала помещается ниша, указывающая верующим направление (киблу), куда надо обращаться во время молитвы.
В задней части молитвенного зала расположен михраб, который означает символ мусульманского единства. Аль-Акса отличается обилием мрамора и ярких красок. Стены мечети украшены софитами, а ее арки - цветной мозаикой. Рисунки изображают зеленые, голубые и красные стилизованные растения, в которые вписывается многоцветовой орнамент.